Equipements Scientifiques
La plateforme est composée des équipements scientifiques suivants:
- SEQUENÇEUR D’ADN,ABI 3500
- PCR EN TEMPS REEL ABI 7500
- CYTOMETRE EN FLUX, BD FACS Canto II
- VICTOR X 2
- CHROMATOGRAPHE EN PHASE GAZEUSE
Description :
Le plateau technique est équipé d’un analyseur d’ADN ABI 3500 (pour le séquençage Sanger et le génotypage) et d’un système de PCR en temps réel ABI 7500.
- L’analyseur d’ADN :
Il est équipé de 8 capillaires (50cm ) et alimenté en polymère de type POP7.
Pour le séquençage, l’analyseur est calibré pour les deux versions de BigDye, V3.1 et V1.1.
Pour le génotypage, il est calibré pour le Dye Set DS-33, permettant l’analyse des fragments d’ADN marqués par les 5 fluorophores suivants : 6-FAM, VIC, NED, PET et LIZ.
Aussi bien pour le séquençage que le génotypage, la durée de migration dépend de la taille du fragment à analyser (entre 40 min et 120 min).
Plus d’informations sont disponibles sur le site de Applied Biosystems
Les applications du séquençeur :
- Le séquençage
- Le génotypage
Il est calibré pour les fluorophores suivants :
- Spectral Calibration Kit I :TAMRA, NED, FAM, VIC, ROX, JOE et SYBR Green.
- Spectral Calibration Kit II : Cy3, Cy5 et Texas Red.
Plus d’informations sont disponibles sur le site de PCR EN TEMPS REEL
Les applications de la PCR en temps réel:
- Les études d’épidémiologie moléculaire
- La détection d’agents pathogènes émergents et la mise en évidence de résistances aux antibiotiques
Le cytomètre en flux, BD FACS Canto II, posséde deux lasers décalés : le laser bleu (excitation à 488 nm) et le laser rouge (excitation à 633 nm) permettant un plus grand choix de fluorochromes (6 couleurs). L’appareil est équipé du logiciel d’acquisition « BD FACS Diva 7 ». Plus d’informations sont disponibles sur le site de BD Facs Canto II
Les applications sont très diverses en raison de la grande variété des réactifs utilisables :
- Immunophénotypage
- Cycle cellulaire
- Apoptose
- Prolifération cellulaire
- Viabilité
Victor X2 de Perkin Elmer (modèle 2030 0020) est un lecteur de plaque multilabel basé sur l’émission et l’absorption de la lumière telque la luminescence et la fluorescence . Il permet d’automatiser la lecture des plaques et établir des cinétiques.
Applications:
- Analyse de la génération de Prothrombine :fonction de thrombinoscope
- Essais Cellulaires: Apoptose, Prolifération…
Plus d’informations sont disponibles sur le site de Victor X2
La chromatographie en phase gazeuse (CPG) est une technique qui permet de séparer des molécules d’un mélange complexe de nature très diverses. Elle s’applique principalement aux composés gazeux ou susceptibles d’être vaporisés par chauffage sans décomposition.
Les applications de la chromatographie en phase gazeuse seront bientôt disponibles.
